百香果高质量基因组获破译

仙仙

近日，中国热带农业科学院海口实验站百香果研究团队在《园艺研究》发表论文，报道了百香果染色体级别基因组，明确了百香果的进化地位，从基因组、转录组和代谢组等多组学角度挖掘了影响百香果风味的潜在基因和基因家族，为百香果改良栽培提供了宝贵资源。


团队测序组装后，获得约1341.7Mb的基因组，Contig N50约3.1Mb，结合Hi-C数据对基因组辅助染色体挂载，得到9条染色体，挂载率高达98.92%。同时，基因组BUSCO评估为91.56%。此外，还预测基因23171个，其中22261个基因被分配到染色体位置，并在基因组中鉴定出994414个重复元件。


研究者还在百香果和其他19种近缘植物中进行基因家族比较分析，共鉴定出368个百香果特有基因家族，采用单拷贝基因家族构建系统发育树，百香果与大戟科亲缘关系最密切，其次是芸苔科。


综合分析基因组、转录组和代谢组的数据显示，α-亚麻酸代谢、代谢途径和次生代谢途径是参与百香果重要挥发性有机物合成的主要途径。研究团队还进一步筛选了一些候选基因。