新冠病毒基因组演化分析和谱系划分有重要进展

仙仙

记者4月5日从中国科学院昆明动物研究所获悉，该所与国内多家研究机构合作，解析了新型冠状病毒基因组的演化规律，提出了具有层次结构的谱系、亚谱系划分系统。《科学通报》期刊发表了这一重要成果。


随着感染人数增加，新冠病毒会快速发展出许多不同的株系。人类急需对这些新出现的变异进行梳理与描述，并更加精细化地展示新冠病毒在人群中的演变轨迹。


中科院昆明动物研究所吕雪梅、张亚平课题组与北京大学生命科学学院陆剑课题组、中国疾病预防控制中心谭文杰课题组等团队合作，分析了121618个高质量病毒基因组中的单核苷酸变异，筛选出201个代表性单核苷酸变异，进而逐级划分出130个亚谱系，绘制成完整的反映各个谱系之间亲缘关系的单倍型网络图，同时建立了实时更新的配套网站以方便查看。


为阐明不同亚谱系病毒的流行程度是否有所不同，研究团队依据谱系划分系统对有具体采样时间信息的119168个高质量病毒基因组进行划分，分析结果显示，在地理条件、交通运输、文化风俗、防疫政策、超级传播者等各种因素共同作用下，病毒谱系在不同地域间有各自独特的分布模式。


研究团队还收集了国内从2020年4月到2021年1月的输入病例数据，将其在谱系划分系统单倍型网络上进行展示，可以为输入性病例的来源提供推断信息。


此项研究囊括了目前出现的绝大多数新冠基因组变异，并整理了其谱系关系，阐明各个谱系时空分布的规律，搭建出新冠病毒演化的大体框架，对理解病原体变异规律、新冠流行病学追踪、预测病毒的演化方向有重要意义。（科技日报记者赵汉斌）