中科院华南植物园首次对喀斯特植物实施全基因组测序

仙仙

中国南方喀斯特起源古老、分布广泛，被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。中科院华南植物园研究员康明团队完成了首个喀斯特植物——怀集报春苣苔的全基因组测序。相关研究近日在线发表于《新植物学家》。


喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分，但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进化的理解还非常缺乏。全基因组复制被认为是物种分化和适应性进化的重要驱动，但被子植物中特定的基因组复制事件在物种多样性形成和适应性进化过程中所起的作用并不清楚。


研究人员在完成喀斯特植物怀集报春苣苔的全基因组测序的基础上，发现该物种在经历了双子叶植物共有的γ基因组复制事件后，又经历了至少两次近期的全基因组复制事件，其中最近一次基因组复制事件为长蒴苣苔亚族植物所共有，发生在大约24.2百万年—20.6百万年前（中新世早期）。


研究人员推测，最近一次基因组复制事件可能促进了长蒴苣苔亚族早期的物种快速分化，并导致了大量基因滞留。


该研究进一步富集分析发现，全基因组复制导致怀集报春苣苔基因组中一些与喀斯特特殊生境相关的基因家族的显著扩张，如WRKY转录因子显著扩张可能有助于怀集报春苣苔适应喀斯特洞穴高盐缺水的特殊生境。